Evropské environmentální nevládní organizace zkritizovaly plánované změny struktury Společné zemědělské politiky (SZP) po roce 2027, které podle nich oslabují podporu ekologických a klimatických opatření. Podle Greenpeace, IFOAM Organics Europe a Evropského úřadu pro životní prostředí (EEB) návrh ruší současný závazek, podle nějž musí minimálně třetina rozpočtu SZP směřovat na ochranu klimatu, přírody a udržitelných zemědělských praktik. Nově bude rozdělení prostředků plně v rukou členských států, což podle organizací hrozí závody ke dnu, roztříštěním politiky a oslabením celounijních cílů.
Greenpeace v reakci ze dne 17/07/2025 upozorňuje, že ukončení systematické podpory pro ekologičtější zemědělství ohrožuje dlouhodobou životaschopnost celého sektoru. Organizace varuje, že ponechání rozhodnutí o výši ekologických výdajů na jednotlivých státech povede k tlakům národních lobbistických skupin a nerovným podmínkám mezi zemědělci. Komise sice podle Greenpeace navrhuje spravedlivější přerozdělení přímých plateb a zastropování nad 100.000 EUR, nezajišťuje ale, že členské státy skutečně nasměrují více prostředků k těm, co to nejvíce potřebují. Environmentální požadavky budou nově formulovány formou pobídek, ale bez vyhrazeného rozpočtu mohou zůstat nerealizovatelné. Organizace také upozorňuje na nové ustanovení o regulaci hustoty hospodářských zvířat v oblastech s vysokým rizikem znečištění dusíkem, ale označuje tato opatření za nedostatečná.
IFOAM Organics Europe označilo návrh Komise z 16/07/2025 za výrazný krok zpět. Kritizuje, že prostředky jsou nově vyhrazeny pouze na přímou podporu vázanou na plochu, zatímco financování agroenvironmentálních opatření bude záviset výhradně na prioritách jednotlivých států. Podle prezidenta organizace Jana Plaggeho chybí jasné směřování evropského rozpočtu k udržitelnosti. Odkazuje přitom i na doporučení Strategického dialogu o budoucnosti zemědělství, který doporučil, aby alespoň třetina rozpočtu SZP byla určena na podporu ekosystémových služeb, včetně ekologického zemědělství. IFOAM upozorňuje, že ekologické zemědělství je již nyní právně upravené na úrovni EU, s certifikačním systémem, a mělo by hrát klíčovou roli v reformované SZP. Za nezbytné považuje stabilní a dlouhodobou podporu pro zemědělce, kteří přispívají k veřejným statkům, a rovné podmínky napříč členskými státy, aby se udržitelnost zemědělství vyplácela.
Evropský úřad pro životní prostředí (EEB) považuje zrušení závazného financování environmentálních cílů za krok, který může vážně ohrozit plnění klimatických a biodiverzitních závazků EU. Podle vyjádření z 16/07/2025 návrh dává členským státům volnou ruku a snižuje ambice v oblasti udržitelnosti, čímž hrozí roztříštění společného trhu a ztráta konkurenceschopnosti. EEB také kritizuje pokračující možnost vázané podpory pro intenzivní živočišnou výrobu nebo investice do neudržitelných zavlažovacích systémů. Ocenění si podle organizace zaslouží pouze návrh na zavedení zastropování a degresivity přímých plateb, stejně jako přechod na podporu na základě schválených transformačních plánů. EEB však zdůrazňuje, že bez zajištěného rozpočtu zůstane většina opatření pouze symbolická a nebude schopna podpořit potřebnou změnu. EEB současně upozorňuje, že návrh Víceletého finančního rámce ruší samostatný program LIFE – dosud jediný rozpočtový nástroj EU určený výhradně na ochranu přírody, klimatu a životního prostředí. Jeho části mají být začleněny do nového Fondu pro evropskou konkurenceschopnost, přičemž zcela chybí zmínka o biodiverzitě. Podle EEB se tím likviduje osvědčený nástroj s vysokou návratností a přínosem pro veřejné zdraví i přírodu. Organizace připomíná, že Evropský parlament v minulosti opakovaně vyzýval k posílení programu LIFE. Vývoj podle EEB ukazuje, že útoky na environmentální organizace a snahy o omezení jejich činnosti nyní přecházejí z politické roviny do rozpočtové praxe.