Evropská komise připustila, že dosavadní praxe plošného vybíjení celých stád při výskytu nákazy je zastaralá a společensky obtížně přijatelná. V připravované Strategii pro živočišnou výrobu chce Komise více prosazovat vakcinaci, přestože uznává riziko obchodních omezení pro produkty z očkovaných zvířat, a chystá také hodnocení zákona o zdraví zvířat. V Řecku bylo kvůli neštovicím ovcí a koz utraceno přes 460 tisíc zvířat, vláda však očkování odmítá kvůli obavám o export sýru feta, což vede některé chovatele k používání nelegálně pašovaných vakcín z Turecka, které komplikují laboratorní diagnostiku přítomnosti nákazy. Řecký premiér Kyriakos Mitsotakis navíc podle médií obvinil evropského komisaře pro zdraví a dobré životní podmínky zvířat Olivéra Várhelyiho, že má v otázce vakcinace „specifickou agendu“, a Mitsotakis tak trvá na tom, že se Řecko bude řídit doporučeními domácího vědeckého výboru, dokud nebude k dispozici vakcína schválená pro použití v EU. Komise naopak zdůrazňuje, že očkování je epidemiologicky doporučené řešení, členské státy mohou v současné době v nouzi použít se souhlasem Komise neschválené vakcíny a potřebné dávky jsou k dispozici v unijní vakcinační bance.